私营企业与个体工商户在投资主体、组织形式和责任承担方式上存在根本差异。私营企业由自然人投资设立并以雇佣劳动为基础,属于营利性经济组织,单位性质为非公有制企业。个体工商户由个人或家庭经营,以个人或家庭财产承担无限责任。