员工恶意删除公司数据和资料属于违法行为,企业可以根据损失轻重,采用追偿、劳动仲裁、民事诉讼、报警立案等方式处理。普通删除行为只会产生民事赔偿责任,员工需要赔付企业数据修复、业务停滞带来的各项损失。如果删除行为造成高额经济损失,员工会满足刑事定罪条件,司法机关可以对其判处刑罚。