不予起诉是检察机关在审查起诉阶段认为不符合起诉条件而作出的处理决定,免于起诉是法院在审判阶段认定构成犯罪但免除刑罚的判决结果。两者在作出主体、适用阶段和法律性质上均有本质差异。免于起诉会留下犯罪记录,对子女政审产生直接影响。